澎湖海洋資源館附設於澎湖縣文化局內，為推廣澎湖海洋文化的重要據點，以澎湖擁有的豐富海洋資源特色為主題，以澎湖的海洋鄉土文化及漁業經濟脈絡為主軸，從保育、知識、生活及歷史四個議題，保存澎湖海洋文化特色，呈現出豐富多元的海洋資源與面向，以達到海洋生態與文化永續發展。

澎湖海洋資源館，分為A館與B館，A館以海洋生態資源為主，展示內容有：走過潮間帶、珊瑚礁生態、海藻的應用、危險的海洋生物、生物的演化、生活中的海味、保育與永續及影片欣賞…等。B館以澎湖漁業活動演進為主，展示內容有：澎湖海域經濟性水產生物資源分佈與漁撈方法、澎湖的漁業種類、澎湖經濟性水產生物、漁村生活實景、漁船的演進、傳統漁具、海洋牧場、海底景觀、未來海底世界…等。

海洋資源館的創建，為民國76年由行政院文建會委託中研院張崑雄博士主持規劃專案，標示出立館旨意在闡揚地域性海洋資源及文化特色，民國83年在鄭明修博士協助下，完成第一期工程，第一期工程分為13個單元，著重於圖照燈片解說，使參觀者瞭解澎湖海洋文化概況，後於民國84年開始陸續辦理第二、三期工程，第二、三期工程則有11個單元，強調實景實務，展現豐沛的海洋資源，民國86年4月時正式開館啟用。

海洋資源館的展示內容以澎湖海洋文化為主，內容包括有漁村生活實景、潮間帶漁作、沿近海漁業、生物的演進、生態保育與資源的永續利用…等，引領民眾探尋澎湖海洋多元文化、澎湖海洋資源、海洋生物多樣性、海洋生態風貌的永續利用與環境變遷，落實海洋教育文化的基礎紮根，激發民眾關注投入海洋保育之新活水。