小門嶼位於澎湖西嶼（漁翁島）的北端，面積為0.5121平方公里，漲潮後就成了單一獨立的島嶼，因為臨近吼門急流，有「吼門之珠」的雅稱，後來興建了小門橋（跨海小橋）與西嶼鄉連結，小門嶼名字由來，是因為小門村東邊有一條小徑，剛好於兩旁的玄武岩峭壁之間，從前小門村居民出入，都得要經過這條小徑，這條小徑遠看就像個門，因此將此地命名為小門，小門嶼是典型的方山地貌，地質景觀是澎湖地形的縮影，融合了景觀與遊憩，是戶外教學的最佳場所，此處規劃有停車場、環島步道…等相關設施，為澎湖著名的風景區。

小門地質館於2000年開始興建，2001年時完工，面積約為498平方公尺，融合菊島特有石材的弧形造型建築，館內以澎湖特有的地形地質為主題，展示澎湖各種類的岩石，館內可參觀到詳細的文字介紹以及圖片展示，以圖文方式展示了小門嶼的自然生態與人文景觀，內部設有七個不同的主題展區：導覽地圖區、澎湖的地景區(澎湖地質年代表)、小門嶼區、小門地質區(小門嶼地層、小門嶼地質、小門嶼地形) 、世界地質區、澎湖地景區、地質觸摸區，都有詳細的介紹，這裡可以一覽澎湖所有岩石的地質風貌，展覽內容十分多樣化，豐富並具有教育功能，尤其是小門嶼的展示空間，感受身歷其境生態的時空之旅，是來到澎湖不可錯過的景點。

館內展示的除了小門的地質構造之外，亦可以說是澎湖岩石與地形的教學中心，展示主題為澎湖的地質、地貌、地形，結合了小門村的自然與人文資源，提供有預約與定時導覽，館內另外設置了旅遊資訊櫃台，有專人提供旅遊諮詢，以及專業的導覽解說服務，並有地質景觀、地形導覽地圖摺頁，免費供遊客索取使用。

館舍周圍有豐富的地質景觀，有造型奇特的玄武岩石柱，以及硓𥑮石築成的景觀，還有外觀形似鯨魚的玄武岩洞，位在小門嶼的鯨魚洞，傳說有巨鯨受困於此處，撞擊而成的，值得前往觀賞遊玩。

參觀資訊
預約導覽：請於參觀前1日，電話預約申請館內解說服務。
免預約：LED液晶螢幕，多媒體影片，每日循環播放。
影片名稱：灑落在台灣海峽的美麗珠串-澎湖地質的奧秘(約15分鐘)。